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Water buffalo genome sequencing

Water-buffalo-genome-sequencing The project aims to obtain the first complete genome sequence of Mediterranean river buffalo. In particular,  the DNA variability of genes encoding for important traits to improve the products of animal origin will be studied by means of sequencing, annotation and candidate gene approach.

Activity start 2010
Publications - NICODEMO D., COPPOLA G., PAUCIULLO A., COSENZA G., RAMUNNO L., CIOTOLA F., PERETTI V., DI MEO G.P., IANNUZZI L., RUBES J., DI BERARDINO  D. (2008). Chromosomal expression and localization of aphidicolin-induced fragile sites in the standard karyotype of river buffalo (Bubalus bubalis). Cytogenetic and Genome Research, 120, 178-182. ISSN: 1424-8581, doi: 10.1159/000118760; ISI: 000255779700026 SCOPUS: 2-s2.0-43449129767 (Q3)
- NICODEMO D., G. COPPOLA., PAUCIULLO A., COSENZA G.,  RAMUNNO L., CIOTOLA F., PERETTI V., DI MEO G.P., IANNUZZI L., RUBES J., DI BERARDINO D. (2007). Mapping fragile-sites in the standard karyotype of River Buffalo (Bubalus bubalis, 2n=50). Italian Journal of Animal Science, 6 (2), 291-294. ISSN: 1594-4077 DOI: 10.4081/ijas.2007.s2.291; ISI: 000207598400037 (Q3)
Permanent staff  
Temporary or external staff Dott. ssa  Elisa Apicella (assegnista di ricerca) UNINA, Dott.ssa Laura Tomasetta (dottoranda di ricerca) UNINA, Dott. Alfredo Pauciullo (Tecnico Laureato) CNR ISPAAM
Collaborations  
SSD  
Projects Ricerca scientifica di interesse nazionale dal titolo “Ricerca e INNOVAzione nelle attività di miglioramento GENetico animale mediante tecniche di genetica molecolare per la competitività del sistema zootecnico nazionale “INNOVAGEN”.  Titolo dell’U.O. “Variabilità di geni candidati per il miglioramento quali-quantitativo del latte bufalino ed individuazione di marcatori associati a differenze nella loro espressione ”. (MIPAAF 2011-2014,  Responsabile prof. Luigi Ramunno, partecipante Gianfranco Cosenza, 300.000,00 euro)
Recognitions and awards  
Scientific events - AJMONE-MASAN P., MARCO MILANESI M.,, BOMBAL., COLLI L., BACCIU N., RAMUNNO L., COSENZA G., COLETTA A, ZICARELLI L., FRITZ E, KOLTES J., REECY J.M., WILLIAMS J., IAMARTINO D., SONSTEGARD T. S., VAN TASSELL C. P., THE INTERNATIONAL BUFFALO CONSORTIUM (2013). Biodiversity among Buffalo genomes. International Plant and Animal Genome Conference Future Dates, XXI Conference, January 12-16,  - San Diego
- MILANESI M., RAMUNNO L., COSENZA G., COLETTA A., ZICARELLI L., FRITZ E. R., KOLTES J. E., REECY J. M., WILLIAMS J., IAMARTINO D., GARCIA J. F., SONSTEGARD T. S., TASSELL C. P., MARSAN P. A. (2013). Whole genome genetic diversity of buffalo. 20th Congress of Animal Science and Production Association, Italian Journal of Animal Science, C-050 DOI: 10.4081/ijas.2013.s179
- IAMARTINO D., WILLIAMS J., RAMUNNO L., AJMONE-MARSAN P., VALENTINI A., MOIOLI B., CHILLEMI G., COLETTA A., ZICARELLI L., IANNUZZI L., CASTIGLIONI B., MACCIOTTA N.P.P., PILLA F., CORRADO F., MATASSINO D., PERETTI V., COSENZA G., D’ANDREA M., INTERNATIONAL BUFFALO GENOME CONSORTIUM. (2013). The sequencing of the Water Buffalo Genome: results and perspectives. 20th Congress of Animal Science and Production Association, Italian Journal of Animal Science, C-051 DOI: 10.4081/ijas.2013.s10.4081/ijas.2013.s17
- AJMONE MARSAN P., IAMARTINO D., BOMBA L., NICOLAZZI E. L., SAHAR SAAD A. S., EL-DIN, HERRERA J. R.V., CRUZ L., ZHANG S., MOKHBER M., MOKHBER M., VLAIC A., RAMUNNO L., COSENZA G., AHMAD A., SOYSAL I., KETUDAT-CAIRNS M., PARNPAI R., GONÇALVES DRUMMOND M. G., GARCIA J. F., GALBUSERA P., BURTON J., HOAL E., VALENTINI A., MOIOLI B., MILANESI M., COLLI L., STELLA A., WILLIAMS J. (2014). An overview of Bus bubalis genetic diversity. Intenational Plant & Animal Genome XXII Conference, January 10-15, San Diego, CA, USA, W115
Technology and know-how transfers  
Other