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Large Scale Analyses of Gene Expression

Large-Scale-analyses-of-gene-expression Main focus: analyses of  data from "omics" strategies to investigate gene networks and gene expression mechanisms in specific conditions, from physiological, to pathological and stress conditions, in animals and plants. Next Generation data are also considered.

Activity start 1999
Publications - Bokszczanin K, Bostan H, Bovy A, Chaturvedi P, Chiusano ML, Firon N, Iannacone R, Jegadees, Klaczynskie K, Li H, Mariani C, Müller F, Paul P, Paupière M, Pressman E, Rieu I, Scharf K.D., Schleiff E, W.vanHeusden A, Vriezen W, Weckwerth W, Winter P, Fragkostefanakis S.Front. Plant Sci., 23 August 2013 | doi: 10.3389/fpls.2013.00315 Perspectives on deciphering mechanisms underlying plant heat stress response and thermotolerance
- Zenoni S, D'Agostino N, Tornielli GB, Quattrocchio F, Chiusano ML, Koes R, Zethof J, Guzzo F, Delledonne M, Frusciante L, Gerats T, Pezzotti M. Revealing impaired pathways in the an11 mutant by high-throughput characterization of Petunia axillaris and Petunia inflata transcriptomes. Plant J. 2011 Oct;68(1):11-27. doi: 10.1111/j.1365-313X.2011.04661.x. Epub 2011 Jul 14. PubMed PMID: 21623977. Q1
- Bernardi J, Licciardello C, Russo MP, Chiusano ML, Carletti G, Recupero GR, Marocco A. Use of a custom array to study differentially expressed genes during blood orange (Citrus sinensis L. Osbeck) ripening. J Plant Physiol. 2010 Mar 1;167(4):301-10. doi: 10.1016/j.jplph.2009.09.009. Epub 2009 Oct 27. Q1
- Alagna F, D'Agostino N, Torchia L, Servili M, Rao R, Pietrella M, Giuliano G, Chiusano ML, Baldoni L, Perrotta G. Comparative 454 pyrosequencing of transcripts from two olive genotypes during fruit development. BMC Genomics. 2009 Aug 26;10:399. doi: 10.1186/1471-2164-10-399. PubMed PMID: 19709400; PubMed Central PMCID: PMC2748093. Q1
- Scala S, Carels N, Falciatore A, Chiusano ML, Bowler C. Genome properties of the diatom Phaeodactylum tricornutum. Plant Physiol. 2002 Jul;129(3):993-1002. PubMed PMID: 12114555; PubMed Central PMCID: PMC166495. Q1
Permanent staff Chiusano Maria Luisa (BIO/11), Frusciante Luigi (AGR/07), Rao Rosa (AGR/07)
Temporary or external staff Collaboratori non strutturati o ex non strutturati che hanno partecipato alle attività:
- D'Agostino Nunzio: ex PhD and Post DOC, attualmente ricercatore al CRA, Pontecagnano Salerno
- Licciardello Concetta ex PhD e attualmente ricercatore al CRA, Acireale, Catania
Collaboratori principali responsabili da altri istituti:
- Baldoni L., Istitute of Plant Genetics, Perugia
- Bowler C., Ecole Normale Supérieure, Parigi, Francia
- Giuliano G., ENEA, Casaccia, Roma
- Perrotta G., ENEA, Trisaia, Matera
- Pezzotti M., Università di Verona, Verona
Consorzio in compartecipazione:
- SPOT ITN
Collaborations  
SSD  
Projects - Agronanotech I (2004-2006) e II (2008-2011), MIPAF, Italia (responsabile UO)
- Genopom I (2005-2010), GenopomPRO and GenHORT (2007-2013), MIUR, Italia (responsabile UO)
- EUSOL, VI programma quadro, EU (responsabile UO), 2005-2010
- SPOT-ITN, VII programma quadro, EU (responsabile UO), 2012-2015
- FP7 COST ACTION FA1106, EU: Coordinatore di gruppo di lavoro, 2012-2015
Recognitions and awards La Dott. Chiusano è invitata come relatore al Festival della Scienza di Genova per partecipare ad un dibattito dal titolo:
- La sfida del XXI secolo: nutrire il pianeta senza danneggiarlo: Riconciliare la conservazione della biodiversità e la sicurezza alimentare
Scientific events La Dott. Chiusano ha organizzato corsi e workshop sull'utilizzo di metodologie bioinformatiche per analisi massiva di dati biologici:
- Montevideo - Uruguay - Organizza il corso Internazionale "Next Generation Sequencing (NGS) data analysis". 15- 22 Novembre 2010
- Napoli - Area di Ricerca CNR Napoli, Organized of the International course "Bioinformatics for Omics Sciences" 25-27 Settembre 2012
- 2009 Vico Equense (NA) - Italia - Corso di aggiornamento: "Le nuove tecnologie per la genomica strutturale e funzionale", 16-18 Febbraio 2009, Progetto Agronanotech 2
Technology and know-how transfers Attività di consulenza per le imprese:
- Nel 2009, la Dott. Chiusano e' diventata consulente per Biosistema, per la "Formazione di alte professionalità per lo sviluppo e la competitività delle imprese con priorità alle PMI"
Other