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Exploring a tomato germplasm collection and identification and transfer of key-genes for increasing antioxidants in tomato fruit

Exploring-a-tomato-germplasm-collection Use of an association mapping approach in a cultivated tomato collection for  detection of new genotypes and new alleles/markers for molecular-assisted breeding approaches.  Genomics and transcriptomics are used to study  molecular mechanisms that trigger biosynthesis and accumulation of antioxidant metabolites in tomato fruit.

Activity start 2004
Publications - Sacco A, Ruggieri V, Molisso M, Barone A, 2013. 'Omics' approaches in tomato aimed at identifying candidate genes for ascorbic acid accumulation in tomato fruit. African J Biotech. 12: 6791-6800  (Q3) '- Barone A,  Chiusano ML, Ercolano MR, Giuliano G, Grandillo S, Frusciante L. Structural and functional genomics of tomato. Inter. J. Plant Genomics. vol. 2008, doi:10.1155/2008/820274 (Q2)
- Barone A , Di Matteo A, Carputo D, Frusciante L. 2009.  High-throughput genomics enhances tomato breeding efficiency. Current Genomics 10:1-9 (Q2)
- Di Matteo A, Ruggieri V, Sacco A, Rigano MM, Carriero F, Bolger A, Fernie AR, Frusciante L, Barone A. 2013. Identification of candidate genes for phenolic accumulation in tomato fruit. Plant Science. 2013 205-206: 87-96 (Q1)
- Di Matteo A, Sacco A,  De Stefano R, Frusciante L, Barone A. 2012. Comparative transcriptomic profiling of two tomato lines with different ascorbate content in tomato fruit. Biochemical Genetics ISSN: 0006-2928, doi: 10.1007/s10528-012-9531-3  (Q3)
- Sacco A, Di Matteo A, Lombardi N, Trotta N, Punzo B, Mari A, Barone A. 2012. Quantitative trait loci pyramiding for fruit quality traits in tomato. Molecular Breeding, pp. 1-6 (Q1)
- Di Matteo A, Sacco A, Ruggieri V, Trotta N, Nunziata A, Barone A. 2010. Transcriptional network controlling antioxidans in tomato fruit. J.Biotechnol. 150: 111-112 (Q1)
- Di Matteo A, Sacco A, Anacleria M, Pezzotti M, Delledonne M, Ferrarini A, Frusciante L, Barone A. 2010. The ascorbic acid content in tomato fruits is associated with the expression of genes involved in pectin degradation. BMC Plant Biology, p. 163 (Q1)
Permanent staff Amalia Barone (PA, AGR-07), Antonio Di Matteo (RU, AGR07), Maria Manuela Rigano (RU, BIO-04)
Temporary or external staff Adriana Sacco (post-doc, UNINA), Valentino Ruggiero (post-doc, UNINA), Roberta Calafiore (post-doc, UNINA); Sereno Sellitto (PhD student, UNINA), Marco Bizzarri (post-doc, UNINA), Elvira Lotti (co.co.co)
Collaborations NAZIONALI: Giovanni Giuliano (ENEA, RM);  Massimo Delledonne (PO, Università di Verona), Alberto Ferrarini (Università di Verona), Silvana Grandillo (CNR, Bari);  Sergio Lanteri (PO, UNITO) 
SSD AGR07; BIO04; BIO18
Projects - Progetto 'ESPLORA' (MiPAAF, partecipante)  '- Le nuove tecnologie molecolari per l’analisi del genoma di organismi di interesse agrario- AgroNANOTECH I e II. Finanziamento AgroNANOTECH I € 360.000. Finanziamento AgroNANOTECH II € 481.000 (MiPAAF  2004-2007 e 2008-2011. Responsabile UO)
- Potenziamento della filiera pomodoro attraverso applicazioni integrate di post-genomica -GenoPOM-pro (PON MiUR. 01/07/2012-30/06/2015. Partecipante)
- Valorizzazione di produzioni ortive campane di eccellenza con strumenti di genomica avanzata - GenHORT  (PON MiUR. 01/07/2012-30/06/2015. Partecipante)
Recognitions and awards  
Scientific events  
Technology and know-how transfers  
Other